A. batunaorum được ghi nhận ở hầu hết vùng biển các nước Đông Nam Á hải đảo, trải dài xuống phía nam đến bờ biển Tây Úc và Lãnh thổ Bắc Úc, mở rộng về phía đông đến một số đảo quốc thuộc châu Đại Dương là Papua New Guinea, Palau và Liên bang Micronesia (cụ thể là tại Yap và Chuuk)[1].

A. batunaorum đặc biệt sống gần những rạn san hô nhánh Acropora ở vùng biển ngoài khơi và trong các đầm phá, độ sâu đến ít nhất là 15 m[1][4].